何かの拍子にファイルがおかしくなってしまったらしく、chkdskがかかるようになった。
chkdsk自体は終わるのだが、再起動後にもう一度chkdskが始まり、結果的にchkdskをキャンセルするまで無限ループを引き起こす。

対策としては以下の通り。
1.一度EWFを無効に設定する。

ewfmgr c: -commitanddisable (-live)

2.再起動すると一度だけchkdskが動くが、繰り返されず、Windowsが起動する。
3.もう一度EWFを有効にする。

ewfmgr c: -enable

これで直りました。すっきり。